Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms