Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh8D3Z6W3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms