Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc170D3YXL0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms