Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn24D3YXJ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn24D3YXJ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn24D3YXJ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn24D3YXJ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn24D3YXJ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms