Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30cD3YVI9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms