Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cttnbp2B9EJA2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cttnbp2B9EJA2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms