Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfia4B8QI36 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms