Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce3B5KM66 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce3B5KM66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms