Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms