Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cped1B2RX70 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cped1B2RX70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms