Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms