Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms