Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2c2A7L9Z8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2c2A7L9Z8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms