Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prss40A6H6T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prss40A6H6T1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms