Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc4a11A2AJN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms