Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm12A2AJ77 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms