Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms