Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms