Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms