Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms