Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28171A0A087WQ19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms