Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28919A0A087WP35 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28919A0A087WP35 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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