Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B654

Trav3-4, T cell receptor alpha variable 3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-4A0A075B654 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav3-4A0A075B654 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav3-4A0A075B654 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav3-4A0A075B654 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav3-4A0A075B654 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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