Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms