Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn3Q9Z0Y1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn3Q9Z0Y1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dctn3Q9Z0Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn3Q9Z0Y1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn3Q9Z0Y1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn3Q9Z0Y1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dctn3Q9Z0Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms