Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhx6Q9R1R0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx6Q9R1R0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx6Q9R1R0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lhx6Q9R1R0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx6Q9R1R0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx6Q9R1R0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx6Q9R1R0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx6Q9R1R0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx6Q9R1R0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhx6Q9R1R0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx6Q9R1R0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx6Q9R1R0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx6Q9R1R0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx6Q9R1R0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhx6Q9R1R0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhx6Q9R1R0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx6Q9R1R0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx6Q9R1R0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx6Q9R1R0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx6Q9R1R0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx6Q9R1R0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx6Q9R1R0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx6Q9R1R0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx6Q9R1R0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx6Q9R1R0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx6Q9R1R0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx6Q9R1R0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhx6Q9R1R0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhx6Q9R1R0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhx6Q9R1R0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx6Q9R1R0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx6Q9R1R0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx6Q9R1R0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx6Q9R1R0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhx6Q9R1R0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms