Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NrkQ9R0G8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
NrkQ9R0G8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
NrkQ9R0G8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NrkQ9R0G8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NrkQ9R0G8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
NrkQ9R0G8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NrkQ9R0G8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NrkQ9R0G8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
NrkQ9R0G8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NrkQ9R0G8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
NrkQ9R0G8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
NrkQ9R0G8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
NrkQ9R0G8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
NrkQ9R0G8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
NrkQ9R0G8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
NrkQ9R0G8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
NrkQ9R0G8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NrkQ9R0G8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
NrkQ9R0G8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NrkQ9R0G8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NrkQ9R0G8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
NrkQ9R0G8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
NrkQ9R0G8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NrkQ9R0G8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NrkQ9R0G8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NrkQ9R0G8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NrkQ9R0G8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NrkQ9R0G8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NrkQ9R0G8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NrkQ9R0G8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
NrkQ9R0G8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NrkQ9R0G8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NrkQ9R0G8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NrkQ9R0G8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NrkQ9R0G8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NrkQ9R0G8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NrkQ9R0G8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NrkQ9R0G8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NrkQ9R0G8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NrkQ9R0G8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
NrkQ9R0G8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NrkQ9R0G8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NrkQ9R0G8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
NrkQ9R0G8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NrkQ9R0G8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NrkQ9R0G8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NrkQ9R0G8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NrkQ9R0G8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NrkQ9R0G8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NrkQ9R0G8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NrkQ9R0G8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
NrkQ9R0G8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NrkQ9R0G8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NrkQ9R0G8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
NrkQ9R0G8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NrkQ9R0G8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NrkQ9R0G8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NrkQ9R0G8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NrkQ9R0G8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NrkQ9R0G8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NrkQ9R0G8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NrkQ9R0G8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms