Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Plxnb3Q9QY40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Plxnb3Q9QY40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Plxnb3Q9QY40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Plxnb3Q9QY40 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Plxnb3Q9QY40 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Plxnb3Q9QY40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Plxnb3Q9QY40 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Plxnb3Q9QY40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Plxnb3Q9QY40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Plxnb3Q9QY40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Plxnb3Q9QY40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Plxnb3Q9QY40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Plxnb3Q9QY40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Plxnb3Q9QY40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Plxnb3Q9QY40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Plxnb3Q9QY40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Plxnb3Q9QY40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Plxnb3Q9QY40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxnb3Q9QY40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxnb3Q9QY40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxnb3Q9QY40 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plxnb3Q9QY40 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plxnb3Q9QY40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Plxnb3Q9QY40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Plxnb3Q9QY40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Plxnb3Q9QY40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Plxnb3Q9QY40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Plxnb3Q9QY40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Plxnb3Q9QY40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Plxnb3Q9QY40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plxnb3Q9QY40 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Plxnb3Q9QY40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Plxnb3Q9QY40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plxnb3Q9QY40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plxnb3Q9QY40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plxnb3Q9QY40 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plxnb3Q9QY40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms