Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Trim44Q9QXA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Trim44Q9QXA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Trim44Q9QXA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Trim44Q9QXA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Trim44Q9QXA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Trim44Q9QXA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Trim44Q9QXA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trim44Q9QXA7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trim44Q9QXA7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Trim44Q9QXA7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Trim44Q9QXA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Trim44Q9QXA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Trim44Q9QXA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trim44Q9QXA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Trim44Q9QXA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Trim44Q9QXA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Trim44Q9QXA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Trim44Q9QXA7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Trim44Q9QXA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Trim44Q9QXA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Trim44Q9QXA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Trim44Q9QXA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trim44Q9QXA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Trim44Q9QXA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Trim44Q9QXA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Trim44Q9QXA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms