Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AatfQ9JKX4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AatfQ9JKX4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AatfQ9JKX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AatfQ9JKX4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
AatfQ9JKX4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AatfQ9JKX4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AatfQ9JKX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AatfQ9JKX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AatfQ9JKX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AatfQ9JKX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AatfQ9JKX4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AatfQ9JKX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AatfQ9JKX4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AatfQ9JKX4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AatfQ9JKX4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AatfQ9JKX4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AatfQ9JKX4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AatfQ9JKX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AatfQ9JKX4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AatfQ9JKX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AatfQ9JKX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AatfQ9JKX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AatfQ9JKX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AatfQ9JKX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms