Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf3Q9JKL4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufaf3Q9JKL4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf3Q9JKL4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf3Q9JKL4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf3Q9JKL4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf3Q9JKL4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf3Q9JKL4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf3Q9JKL4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf3Q9JKL4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf3Q9JKL4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf3Q9JKL4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf3Q9JKL4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf3Q9JKL4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf3Q9JKL4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf3Q9JKL4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf3Q9JKL4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf3Q9JKL4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf3Q9JKL4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf3Q9JKL4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf3Q9JKL4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufaf3Q9JKL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf3Q9JKL4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf3Q9JKL4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf3Q9JKL4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufaf3Q9JKL4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms