Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ybx3Q9JKB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ybx3Q9JKB3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ybx3Q9JKB3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ybx3Q9JKB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ybx3Q9JKB3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ybx3Q9JKB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ybx3Q9JKB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ybx3Q9JKB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ybx3Q9JKB3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ybx3Q9JKB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ybx3Q9JKB3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ybx3Q9JKB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ybx3Q9JKB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ybx3Q9JKB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ybx3Q9JKB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ybx3Q9JKB3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ybx3Q9JKB3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ybx3Q9JKB3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ybx3Q9JKB3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ybx3Q9JKB3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ybx3Q9JKB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ybx3Q9JKB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ybx3Q9JKB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ybx3Q9JKB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ybx3Q9JKB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Ybx3Q9JKB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ybx3Q9JKB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Ybx3Q9JKB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ybx3Q9JKB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ybx3Q9JKB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ybx3Q9JKB3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ybx3Q9JKB3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ybx3Q9JKB3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ybx3Q9JKB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ybx3Q9JKB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ybx3Q9JKB3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ybx3Q9JKB3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ybx3Q9JKB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ybx3Q9JKB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ybx3Q9JKB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ybx3Q9JKB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ybx3Q9JKB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ybx3Q9JKB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ybx3Q9JKB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ybx3Q9JKB3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ybx3Q9JKB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ybx3Q9JKB3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ybx3Q9JKB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ybx3Q9JKB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ybx3Q9JKB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ybx3Q9JKB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms