Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrip2Q9JHR9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrip2Q9JHR9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrip2Q9JHR9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrip2Q9JHR9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrip2Q9JHR9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrip2Q9JHR9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrip2Q9JHR9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrip2Q9JHR9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrip2Q9JHR9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrip2Q9JHR9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip2Q9JHR9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip2Q9JHR9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip2Q9JHR9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrip2Q9JHR9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrip2Q9JHR9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip2Q9JHR9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip2Q9JHR9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrip2Q9JHR9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrip2Q9JHR9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms