Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan4Q9DCK3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan4Q9DCK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tspan4Q9DCK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan4Q9DCK3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan4Q9DCK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan4Q9DCK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan4Q9DCK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan4Q9DCK3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms