Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhc1Q9D9T8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhc1Q9D9T8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efhc1Q9D9T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efhc1Q9D9T8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efhc1Q9D9T8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efhc1Q9D9T8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhc1Q9D9T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efhc1Q9D9T8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efhc1Q9D9T8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efhc1Q9D9T8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhc1Q9D9T8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Efhc1Q9D9T8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efhc1Q9D9T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efhc1Q9D9T8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhc1Q9D9T8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efhc1Q9D9T8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhc1Q9D9T8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efhc1Q9D9T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhc1Q9D9T8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhc1Q9D9T8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efhc1Q9D9T8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efhc1Q9D9T8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhc1Q9D9T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms