Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q3

1700034I23Rik, RIKEN cDNA 1700034I23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034I23RikQ9D9Q3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
1700034I23RikQ9D9Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700034I23RikQ9D9Q3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700034I23RikQ9D9Q3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700034I23RikQ9D9Q3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700034I23RikQ9D9Q3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700034I23RikQ9D9Q3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700034I23RikQ9D9Q3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700034I23RikQ9D9Q3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700034I23RikQ9D9Q3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700034I23RikQ9D9Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms