Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pus10Q9D3U0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pus10Q9D3U0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pus10Q9D3U0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pus10Q9D3U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pus10Q9D3U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pus10Q9D3U0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pus10Q9D3U0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pus10Q9D3U0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pus10Q9D3U0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pus10Q9D3U0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pus10Q9D3U0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pus10Q9D3U0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pus10Q9D3U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pus10Q9D3U0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pus10Q9D3U0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pus10Q9D3U0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pus10Q9D3U0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pus10Q9D3U0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pus10Q9D3U0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pus10Q9D3U0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pus10Q9D3U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pus10Q9D3U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pus10Q9D3U0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pus10Q9D3U0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pus10Q9D3U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pus10Q9D3U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pus10Q9D3U0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pus10Q9D3U0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pus10Q9D3U0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pus10Q9D3U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pus10Q9D3U0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pus10Q9D3U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pus10Q9D3U0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pus10Q9D3U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pus10Q9D3U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pus10Q9D3U0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pus10Q9D3U0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pus10Q9D3U0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pus10Q9D3U0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pus10Q9D3U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pus10Q9D3U0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pus10Q9D3U0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pus10Q9D3U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pus10Q9D3U0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pus10Q9D3U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pus10Q9D3U0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pus10Q9D3U0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pus10Q9D3U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus10Q9D3U0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pus10Q9D3U0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus10Q9D3U0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus10Q9D3U0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pus10Q9D3U0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms