Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps33aQ9D2N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps33aQ9D2N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps33aQ9D2N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps33aQ9D2N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33aQ9D2N9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps33aQ9D2N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vps33aQ9D2N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps33aQ9D2N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps33aQ9D2N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33aQ9D2N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33aQ9D2N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps33aQ9D2N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps33aQ9D2N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33aQ9D2N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps33aQ9D2N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps33aQ9D2N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps33aQ9D2N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vps33aQ9D2N9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps33aQ9D2N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33aQ9D2N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps33aQ9D2N9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps33aQ9D2N9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps33aQ9D2N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps33aQ9D2N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33aQ9D2N9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33aQ9D2N9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33aQ9D2N9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33aQ9D2N9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps33aQ9D2N9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33aQ9D2N9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms