Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D930007J09RikQ9D2K6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D930007J09RikQ9D2K6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D930007J09RikQ9D2K6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D930007J09RikQ9D2K6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D930007J09RikQ9D2K6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D930007J09RikQ9D2K6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D930007J09RikQ9D2K6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D930007J09RikQ9D2K6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
D930007J09RikQ9D2K6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D930007J09RikQ9D2K6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D930007J09RikQ9D2K6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
D930007J09RikQ9D2K6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
D930007J09RikQ9D2K6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D930007J09RikQ9D2K6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D930007J09RikQ9D2K6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D930007J09RikQ9D2K6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D930007J09RikQ9D2K6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D930007J09RikQ9D2K6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms