Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cysrt1Q9D1E4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cysrt1Q9D1E4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cysrt1Q9D1E4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cysrt1Q9D1E4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cysrt1Q9D1E4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cysrt1Q9D1E4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cysrt1Q9D1E4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cysrt1Q9D1E4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cysrt1Q9D1E4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cysrt1Q9D1E4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cysrt1Q9D1E4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cysrt1Q9D1E4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cysrt1Q9D1E4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cysrt1Q9D1E4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cysrt1Q9D1E4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cysrt1Q9D1E4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cysrt1Q9D1E4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cysrt1Q9D1E4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cysrt1Q9D1E4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cysrt1Q9D1E4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cysrt1Q9D1E4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cysrt1Q9D1E4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cysrt1Q9D1E4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cysrt1Q9D1E4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cysrt1Q9D1E4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms