Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr13Q9CQJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prr13Q9CQJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr13Q9CQJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr13Q9CQJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr13Q9CQJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr13Q9CQJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr13Q9CQJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr13Q9CQJ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms