Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nus1Q99LJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nus1Q99LJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nus1Q99LJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nus1Q99LJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nus1Q99LJ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nus1Q99LJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nus1Q99LJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nus1Q99LJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nus1Q99LJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nus1Q99LJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nus1Q99LJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nus1Q99LJ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nus1Q99LJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nus1Q99LJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nus1Q99LJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nus1Q99LJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nus1Q99LJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nus1Q99LJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nus1Q99LJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nus1Q99LJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nus1Q99LJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nus1Q99LJ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nus1Q99LJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nus1Q99LJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nus1Q99LJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms