Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GhdcQ99J23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GhdcQ99J23 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GhdcQ99J23 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GhdcQ99J23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GhdcQ99J23 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GhdcQ99J23 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GhdcQ99J23 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GhdcQ99J23 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GhdcQ99J23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GhdcQ99J23 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GhdcQ99J23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GhdcQ99J23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GhdcQ99J23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GhdcQ99J23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GhdcQ99J23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GhdcQ99J23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GhdcQ99J23 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GhdcQ99J23 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GhdcQ99J23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GhdcQ99J23 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GhdcQ99J23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GhdcQ99J23 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GhdcQ99J23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GhdcQ99J23 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GhdcQ99J23 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GhdcQ99J23 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GhdcQ99J23 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1065.4 ms