Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ctu1Q99J10 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ctu1Q99J10 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ctu1Q99J10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ctu1Q99J10 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ctu1Q99J10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ctu1Q99J10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ctu1Q99J10 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ctu1Q99J10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ctu1Q99J10 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ctu1Q99J10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ctu1Q99J10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ctu1Q99J10 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ctu1Q99J10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Ctu1Q99J10 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ctu1Q99J10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ctu1Q99J10 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ctu1Q99J10 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ctu1Q99J10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ctu1Q99J10 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ctu1Q99J10 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ctu1Q99J10 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ctu1Q99J10 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ctu1Q99J10 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ctu1Q99J10 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ctu1Q99J10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ctu1Q99J10 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ctu1Q99J10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Ctu1Q99J10 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ctu1Q99J10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ctu1Q99J10 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ctu1Q99J10 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ctu1Q99J10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ctu1Q99J10 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Ctu1Q99J10 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms