Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Traf7Q922B6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Traf7Q922B6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Traf7Q922B6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Traf7Q922B6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Traf7Q922B6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Traf7Q922B6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Traf7Q922B6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Traf7Q922B6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Traf7Q922B6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Traf7Q922B6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Traf7Q922B6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Traf7Q922B6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Traf7Q922B6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Traf7Q922B6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Traf7Q922B6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Traf7Q922B6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Traf7Q922B6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Traf7Q922B6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Traf7Q922B6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Traf7Q922B6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Traf7Q922B6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Traf7Q922B6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Traf7Q922B6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Traf7Q922B6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Traf7Q922B6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Traf7Q922B6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Traf7Q922B6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Traf7Q922B6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Traf7Q922B6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms