Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam3cQ91VU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam3cQ91VU0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam3cQ91VU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam3cQ91VU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam3cQ91VU0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam3cQ91VU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam3cQ91VU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam3cQ91VU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam3cQ91VU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam3cQ91VU0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam3cQ91VU0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam3cQ91VU0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam3cQ91VU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam3cQ91VU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam3cQ91VU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam3cQ91VU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam3cQ91VU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam3cQ91VU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam3cQ91VU0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam3cQ91VU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam3cQ91VU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam3cQ91VU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam3cQ91VU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam3cQ91VU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam3cQ91VU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam3cQ91VU0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam3cQ91VU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam3cQ91VU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam3cQ91VU0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam3cQ91VU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam3cQ91VU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam3cQ91VU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam3cQ91VU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam3cQ91VU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam3cQ91VU0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms