Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubg2Q8VCK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubg2Q8VCK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubg2Q8VCK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubg2Q8VCK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubg2Q8VCK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubg2Q8VCK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubg2Q8VCK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubg2Q8VCK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubg2Q8VCK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubg2Q8VCK3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubg2Q8VCK3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubg2Q8VCK3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubg2Q8VCK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubg2Q8VCK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubg2Q8VCK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubg2Q8VCK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubg2Q8VCK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubg2Q8VCK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubg2Q8VCK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubg2Q8VCK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubg2Q8VCK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubg2Q8VCK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubg2Q8VCK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubg2Q8VCK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubg2Q8VCK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubg2Q8VCK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubg2Q8VCK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms