Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H5

Myo3a, Myosin-IIIa, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3aQ8K3H5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Myo3aQ8K3H5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Myo3aQ8K3H5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.7
Myo3aQ8K3H5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Myo3aQ8K3H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Myo3aQ8K3H5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Myo3aQ8K3H5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Myo3aQ8K3H5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Myo3aQ8K3H5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Myo3aQ8K3H5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Myo3aQ8K3H5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Myo3aQ8K3H5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Myo3aQ8K3H5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Myo3aQ8K3H5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Myo3aQ8K3H5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myo3aQ8K3H5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Myo3aQ8K3H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Myo3aQ8K3H5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Myo3aQ8K3H5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Myo3aQ8K3H5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Myo3aQ8K3H5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Myo3aQ8K3H5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Myo3aQ8K3H5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Myo3aQ8K3H5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Myo3aQ8K3H5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Myo3aQ8K3H5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Myo3aQ8K3H5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Myo3aQ8K3H5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Myo3aQ8K3H5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Myo3aQ8K3H5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Myo3aQ8K3H5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Myo3aQ8K3H5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Myo3aQ8K3H5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Myo3aQ8K3H5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Myo3aQ8K3H5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Myo3aQ8K3H5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Myo3aQ8K3H5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Myo3aQ8K3H5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Myo3aQ8K3H5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Myo3aQ8K3H5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Myo3aQ8K3H5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Myo3aQ8K3H5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Myo3aQ8K3H5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Myo3aQ8K3H5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Myo3aQ8K3H5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Myo3aQ8K3H5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Myo3aQ8K3H5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Myo3aQ8K3H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Myo3aQ8K3H5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Myo3aQ8K3H5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Myo3aQ8K3H5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms