Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcf3Q8K268 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf3Q8K268 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf3Q8K268 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcf3Q8K268 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcf3Q8K268 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcf3Q8K268 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcf3Q8K268 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcf3Q8K268 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcf3Q8K268 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcf3Q8K268 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf3Q8K268 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcf3Q8K268 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf3Q8K268 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf3Q8K268 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcf3Q8K268 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf3Q8K268 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf3Q8K268 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms