Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nek9Q8K1R7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nek9Q8K1R7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nek9Q8K1R7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nek9Q8K1R7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Nek9Q8K1R7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nek9Q8K1R7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nek9Q8K1R7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nek9Q8K1R7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nek9Q8K1R7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nek9Q8K1R7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nek9Q8K1R7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nek9Q8K1R7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nek9Q8K1R7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nek9Q8K1R7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nek9Q8K1R7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nek9Q8K1R7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Nek9Q8K1R7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Nek9Q8K1R7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nek9Q8K1R7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nek9Q8K1R7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nek9Q8K1R7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nek9Q8K1R7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nek9Q8K1R7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nek9Q8K1R7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nek9Q8K1R7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nek9Q8K1R7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nek9Q8K1R7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nek9Q8K1R7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nek9Q8K1R7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nek9Q8K1R7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nek9Q8K1R7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
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