Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Nek9Q8K1R7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Nek9Q8K1R7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Nek9Q8K1R7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Nek9Q8K1R7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Nek9Q8K1R7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Nek9Q8K1R7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Nek9Q8K1R7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Nek9Q8K1R7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Nek9Q8K1R7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Nek9Q8K1R7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Nek9Q8K1R7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Nek9Q8K1R7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Nek9Q8K1R7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Nek9Q8K1R7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Nek9Q8K1R7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Nek9Q8K1R7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Nek9Q8K1R7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Nek9Q8K1R7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Nek9Q8K1R7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nek9Q8K1R7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nek9Q8K1R7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nek9Q8K1R7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Nek9Q8K1R7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nek9Q8K1R7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Nek9Q8K1R7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nek9Q8K1R7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nek9Q8K1R7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Nek9Q8K1R7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nek9Q8K1R7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Nek9Q8K1R7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Nek9Q8K1R7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nek9Q8K1R7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nek9Q8K1R7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Nek9Q8K1R7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Nek9Q8K1R7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,7 ms